Blog20210912 をテンプレートにして作成

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[[Blogs]] **脱パイロジェン　Depyrogenation 滅菌処理のことであり，細菌エンドトキシン（グラム陰性桿菌... **計算生化学についての展望記事について Out-of-Equilibrium Biophysical Chemistry: The Case for Mu... [[DOI:https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c02424]] STRUCTURE−DYNAMICS−FUNCTION RELATIONSHIP IN BIOMOLECULES ... Free energy landscapes　自由エネルギー描像では，熱力学的... Equilibrium energy landscapes　平衡エネルギー描像では，局... Out-of-equilibrium energy landscapes　モーター分子など，... ケース１　局所安定な複数の分子構造間を高速に遷移する．基... ケース２　構造間の遷移は低速．　始状態と終状態に集約でき... ケース３　ケース１と２の中間領域 Multidimensional energy landscapes　多次元の反応座標上の... 非平衡のシステムは，必ずしも多次元の反応座標上のダイナミ... そのため，実験的にも観測可能な疑似１次元のポテンシャル表... Mapping the multidimensional functional energy landscape ... 計測手法（X線，NMR，EPR）を使って，構造を特定し，多次元の... ここでは，TPP の riboswitch という対象に対して，分子動力... TPP　は　Arabidopsis thaliana thiamine pyrophosphate のこと **リボスイッチ（Riboswitch） mRNA分子の一部分で、低分子化合物がそこに特異的に結合する... 最初の報告　Nature volume 419, pages 952–956 (2002) [[htt... RNAワールド仮説とは、生命は初めRNAだけを利用しており、タ...

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[[Blogs]] **脱パイロジェン　Depyrogenation 滅菌処理のことであり，細菌エンドトキシン（グラム陰性桿菌... **計算生化学についての展望記事について Out-of-Equilibrium Biophysical Chemistry: The Case for Mu... [[DOI:https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.1c02424]] STRUCTURE−DYNAMICS−FUNCTION RELATIONSHIP IN BIOMOLECULES ... Free energy landscapes　自由エネルギー描像では，熱力学的... Equilibrium energy landscapes　平衡エネルギー描像では，局... Out-of-equilibrium energy landscapes　モーター分子など，... ケース１　局所安定な複数の分子構造間を高速に遷移する．基... ケース２　構造間の遷移は低速．　始状態と終状態に集約でき... ケース３　ケース１と２の中間領域 Multidimensional energy landscapes　多次元の反応座標上の... 非平衡のシステムは，必ずしも多次元の反応座標上のダイナミ... そのため，実験的にも観測可能な疑似１次元のポテンシャル表... Mapping the multidimensional functional energy landscape ... 計測手法（X線，NMR，EPR）を使って，構造を特定し，多次元の... ここでは，TPP の riboswitch という対象に対して，分子動力... TPP　は　Arabidopsis thaliana thiamine pyrophosphate のこと **リボスイッチ（Riboswitch） mRNA分子の一部分で、低分子化合物がそこに特異的に結合する... 最初の報告　Nature volume 419, pages 952–956 (2002) [[htt... RNAワールド仮説とは、生命は初めRNAだけを利用しており、タ...

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