Blog20210912 のバックアップ(No.1)
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滅菌処理のことであり，細菌エンドトキシン（グラム陰性桿菌の細胞壁の構成成分であるリポ多糖類（LPS））の破壊または除去 のこと．
Out-of-Equilibrium Biophysical Chemistry: The Case for Multidimensional, Integrated Single-Molecule Approaches
STRUCTURE−DYNAMICS−FUNCTION RELATIONSHIP IN BIOMOLECULES 分子は構造と変化，その機能が疑問である．
Free energy landscapes 自由エネルギー描像では，熱力学的平衡状態の連続体近似となっている．
Equilibrium energy landscapes 平衡エネルギー描像では，局所平衡の状態に部分的に分布し，その状態への遷移を含めて考えられている．
Out-of-equilibrium energy landscapes モーター分子など，エネルギーを使って非平衡な状態にある分子を取り扱うには，
ケース１ 局所安定な複数の分子構造間を高速に遷移する．基底状態と励起状態の占有分布の定常状態に依存する．
ケース２ 構造間の遷移は低速． 始状態と終状態に集約できる．
ケース３ ケース１と２の中間領域
Multidimensional energy landscapes 多次元の反応座標上のダイナミクスを取り扱う
非平衡のシステムは，必ずしも多次元の反応座標上のダイナミクスとも言えない．分子の構造変化の方が大きいため，ポテンシャル表面の歪みが大きくなる．
そのため，実験的にも観測可能な疑似１次元のポテンシャル表面を用意することを提案する．
Mapping the multidimensional functional energy landscape in equilibrium and nonequilibrium systems
計測手法（X線，NMR，EPR）を使って，構造を特定し，多次元のポテンシャル表面にマッピングしていくことで，堅牢な解析（予測）結果を得られると考える．
ここでは，TPP の riboswitch という対象に対して，分子動力学，蛍光顕微鏡，単分子動的分子間力分光法を使うという提案がなされている．
TPP は Arabidopsis thaliana thiamine pyrophosphate のこと